人身虽有三丹田、五丹田之说，但实际练功时，除特殊情况之外，一般所说意守丹田，都是指意守下丹田。古人认为下丹田和人体生命活动的关系最为密切。是“性命之祖”、“生气之源”、“五脏六腑之本”、“十二经之根”、“阴阳之会”、“呼吸之门”、“水火交会之乡”，是真气升降开合的枢纽，是汇集烹炼、储存真气的重要部位。当然，从现代解剖学和生理学的观点看，下丹田所在的部位至今并未发现有特殊的形态和功能。但是，通过意守丹田来促进练功人的意识达到入静状态，取得疗效，则早已被实践所证实。其中的机理，有待于人们进一步研究、揭示。
丹田在何处，说法不一。多数气功家认为，丹田有上丹田、中丹田和下丹田。上丹田叫“泥丸”，在头顶百会穴，有的说在两眉间印堂穴。中丹田叫“绛宫”，在胸部膻中穴。下丹田在脐下小腹部相当大的一块体积，包括关元、气海，神阙、命门等穴位。还有人认为丹田在脐上，又称祖窍。也有人说巨阙穴为中丹田，又名灵台。下丹田为足掌心之涌泉。其说不一。
古人认为丹田是滋养全身的重要部位，故有“无火能使百体皆温，无水能使脏腑皆润，关系全身性命，此中一线不绝，则生命不亡”的说法。
上丹田：为印堂所在，亦即泥丸宫、升阳府、昆仑顶、灵台等，道家所指名称甚多，可以说是各自命名，众说纷纭，不过多指脑而言。其中玄关所指在两目两眉与额、鼻骨之十字中心处，道家对此也十分重视，认为是入道之门，或泛指气功基础，认为是天地灵根，是祖窍、祖气，至宝至贵。
上丹田在督脉的循行路上，属于阳性，是阳气集中的地方，是藏神之所，是主管意识活动的神经中枢所在。是练功入静的主要部位。上丹田的作用是锻炼神经系统，控制自己的意识活动，调节、增强神经中枢，抑制整体代谢机能，从而发挥贮能性效应。这有助于休养生息，积聚精力与疾病作斗争，获得健康。所以，练功后感到体力增强，精力充沛，是有道理的。
上丹田在头部，头部为诸阳之会，凡气虚下陷，头部怕风寒，以及脑贫血、低血压病人，可意守上丹田，但初学气功者，不要马上意守上丹田，以免气机上窜引起头晕；阳盛的病人也不要意守上丹田。
中丹田：为膻中所在，为自承浆下十二层楼指喉管至黄庭指人体内中虚空窍，或在心之下……，以牛郎代表心为阳，有肝胆脾均各自专职，共同耕种心田，故有“我家专种自家田，可育灵苗活万年……灌溉须凭上谷泉指舌顶上颚，所谓白头老子眉垂地之律液至上鹊桥，有朝一日功行满，便是蓬莱大罗仙。”
中丹田在胸部，如病人是中气下陷，妇女月经过多，可意守中丹田，但容易引起胸闷，要慎重使用。
下丹田：即正丹田，在脐下，或有称之为气海，藏命之所，以织女代表肾为阴性。
按道家以织女喻肾，为真阴，在卦为坎；以牛郎喻心，为真阳，在卦为离，阴阳合则为真夫妻，阴阳合则生丹药，所以还有坎离***，男女媾精阴阳合而生丹药之喻。心肾交，水火交，龙虎交之类等等，也都是指练功中之术语。“水火交炼池”即喻心肾相交之处所。