上回说到，唐景崧招抚刘永福成功。发放官府印信，与东海舰队联络方式。当夜黑旗军便突破法军阵地，打通沿海通道。
东海舰队特遣队，由两艘定远级铁甲舰、五艘千吨级炮舰，两艘022导弹艇，两艘补给船组成。
远洋行军十几日，到达越南海域，刘永福派出渔民相迎，对上了暗号信物，补给舰便放出小船，分批将苏式栓动步枪、山炮、火箭筒等武器弹药运送过来。
刘永福亲切接见了舰队司令，双方约定，待进攻河内时机成熟。互相支援作战。
冯子材那边已在广西招募旧部，广纳新兵。韩林通过空运将军饷运送至前线，安定军心。
可越南境内清军，群龙无首，各将分属不同派系，以至于节节败退。五月十日，谅山各营被法军一举击溃。十五日，法军进犯文渊州，守将杨玉科力战牺牲，清军纷纷后撤。
法军乘势侵占广西门户镇南关，炸毁关门，并在关前废墟中插上一块木牌，得意地用汉字写着“广西的门户已不再存在了”，广西军民在法军退走后在关前插上木桩，写上“我们将用法国人的头颅重建我们的门户！”作为对法国侵略军的回答。
冯子材赶到镇南关后，根据前线清军各部之间多存派系门户之见的情况，首先召集前敌诸将晓以大义，使各将领在抗击侵略者的斗争中团结起来。各将领共推冯子材为前敌主帅，统一指挥协调各军的行动，已从镇南关退至文渊、谅山，准备组织新的进攻。
法军眼见镇南关被重建，清军又陆续收复越南失地。再次重新集结大军，对清军展开猛烈反扑。刘永福部协同作战，无奈人少，纵使东海舰队炮火支援，可毕竟射程有限无济于事。
清军败退至镇南关，法军主力在炮火掩护下，攻占东岭三座堡垒。并猛攻长墙。冯子材指挥所部顽强抵抗，在丢失三座堡垒的危急关头，冯子材大声疾呼：“法再入关，有何面目见粤民？何以生为？”
守军受到鼓舞，终将法军击退。次日尼格里指挥法军在炮火掩护下，分三路再次发起攻击，沿东岭、西岭和中路谷地进攻关前隘阵地。
冯子材传令各部将领：“有退者，无论何将遇何军，皆诛之”。经激战，法军接近长墙，冯子材持刀大呼，率先率领两个儿子跃出长墙，冲向法军。全军感奋，一齐出击，与其进行白刃格斗，战斗异常惨烈。
傍晚，多路清军绕后包抄，法军三面被围，死伤甚众，后援断绝，弹药将尽，被迫败退，尼格里只得下令撤退，狼狈逃回文渊、谅山。冯子材抓紧有利战机，率部乘胜追击，于26日攻克文渊，29日攻克谅山，宣称毙法军近千名，重伤法军指挥官尼格里。
法军狼狈逃回河内，固守待援。然而此战清军已筋疲力尽，刘永福部伤亡近千人，战守两难，进退失据。财政方面，四省已无力继续供给军饷。
战争陷入胶着状态，法国开始寻求谈判解决，朝廷派曾国荃与法国代表巴德诺在杭州和谈。和谈期间，法军继续制造事端，再次挑起战争。
法国将它在中国和越南的舰队合成远东舰队，任命孤拔为统帅，沿海岸线攻击前进。广东水师此前奉韩林之命，外出巡弋，未与法军接触。因此躲过一劫，广东自林则徐销烟后一直重视岸防建设。法军因此不敢攻击广东沿海。
福建水师新任提督受奕譞密令，公然抵抗韩林调令。一直龟缩于港口，法军攻打台湾基隆，早有雷达预警，却仍袖手旁观。台湾巡抚刘铭传率台湾军民奋力抵抗，紧急情况下动用两发导弹，方才使得法军军舰退却。
六月，法国舰队突然偷袭停泊在马尾军港的福建水师，水师前出海岸三十余海里，与法军对峙。鉴于清法两国正在和谈，福建水师严守提督大人命令——绝不不主动挑衅。法国军舰未理会福建水师旗语，占据有利攻击位置。随后开火。