朱由崧知道，这么大张旗鼓地调动，必为清军所知晓，南明与清军的冲突将提前到来，历史轨迹的改变由此开始。
随即在新军大营，朱由崧又组织了军事演习。
重点进行沙盘推演：新军防守、布阵。没有大炮，新军现在达不到进攻的条件。
清军厉害的地方在野战、攻城，清军仿制的红夷大炮质量已经超过了明朝的火炮，射程能达到四里。因此，朱由崧要求，防守时候不守城池，在野外进行防御，红夷大炮打不了野外战壕。
朱由崧的逻辑是，在城外挖战壕，战壕外置250米处布置据马，据马后面挖坑埋设木尖。清军的强弓射程达到150米，这样既能阻止清军骑兵快速攻击，又使清军弓箭无法射到战壕，而我们的步枪能有效射击敌军。新军骑兵在敌军进攻达到强弩之末后，从两翼攻击，敌军退败后即收队。我们现在处于防御阶段，不对敌军进行攻击势态。
这样从排级单位起到连、营、旅，反复操练。
此时，物资源源不断送进军营，除了步枪、军服、工兵铲未齐，其它都到位了。
新1军，战马全部到位；军服配备了3个旅；步枪配备了10个连队，确保新1军每个旅有2个连队配备了步枪。
新2军，满装一个营，是201旅阮进的第一步兵营。
朱由崧命令：
黄得功，带领201旅第一步兵营到安庆布防，防备左良玉军团从九江侵入。后续满装营将陆续配备到第一线。
袁枢新1军，左懋第101旅2个满装连队，占领归德；刘肇基102旅2个满装连队，去临沂布防；阎尔梅103旅2个满装连队，布防济宁；马鸣录104旅2个满装连队，布防兖州；路振飞105骑兵旅2个满装连队，布防沛县，袁枢指挥部设在沛县，左右机动，马上做出动员令。定于七月初七举行大营阅兵式，阅兵后满装部队即刻出发。
通知郑森，调集运输船舶到扬州候命；给太仓船厂再拨银30万两，加快造船速度。
皇后娘娘来报，不日将启程巡视扬州内衣店、皇家商社、制衣厂等情况，朱由崧知道皇后娘娘想老公了。命卞玉京把水绘园布置一下，待皇后到，后宫全部住到水绘园去。命令沐剑屏带女兵卫队去南京接皇后娘娘。
史可法坐船从广州回到了扬州。
史可法去福建广东一月有余，回扬州一看，怪怪不得了，军营、工厂、码头、商店热火朝天，大明中兴迹象明了。史可法心中一想，弘光帝大有超过太祖太宗的苗头，跟对人了。
史可法向朱由崧汇报了海关情况：六大开埠城市全部设立海关，民间发展贸易、渔业兴致高涨；解除海禁后，各港口商船、渔船如织；江南的丝绸、茶叶、陶器等出口东洋、南洋，可以有5倍的利润，这样民间也愿意交税；同时进口了白银、矿产、粮食等朝廷紧缺物资；现在光海关税银，六个城市每月能有40多万两收入；桂王朱由榔到了广州，组建了南方农垦集团，收留船运的南下难民达20万人之巨，在海南、雷州一带开垦建设，不过前期花费也达到是惊人的100万两银子；外交部在筹建中，但已经先在爪哇岛设立了外交使馆。
史可法越讲越兴奋。。。。。。
朱由崧命令史可法去南京，协助沐天波推行盐政、税务新政；
史可法领命而去。
朱由崧又命令顾炎武准备向娘娘李香君交接《大明周报》，到扬州负责统筹军事物资，接管新军大营。
南京的奏章如雪片般送达扬州。主要是钱谦益、马士英、阮大铖等发来，为冒氏、侯氏父子求情以及反对盐政新法令。声称皇上的措施寒了江南士绅的心，要求朱由崧将冒氏、侯氏父子押解到南京刑部审理，要求盐政推后处理。
朱由崧将奏章全部转给史可法，让他去南京与钱谦益、马士英等人扯皮去。