这只是西方的宗教战争，在天朝，宗教引起的战斗了不少。汉朝的黄巾起义。
黄巾起义，是东汉晚期的农民战争，也是中国历史上规模最大的一次宗教形式组织的民变之一。
虽然叛乱失败了，但是对东汉朝廷的统治产生了巨大的冲击，为平息叛乱，各地拥兵自重，虽最终起义以失败而告终，但军阀割据、东汉名存实亡的局面也不可挽回，最终导致三国局面的()
形成。
再比如造反专业户，白莲教。
洪武、永乐年间，川鄂赣鲁等地多次发生白莲教徒武装***，有的还建号称帝，均被镇压。永乐、正统、成化、弘治、正德、万历年间都有白莲教聚众作乱，地点从湖北、江西到四川、山西、山东乃至于京都顺天府都难以幸免。
在嘉靖年间，还发生了著名的李福达案、朱充灼之乱。这些都和白莲教有着直接关系。
明朝中后期，白莲教甚至和蒙古势力互相勾结。
不过明中叶以后，民间宗教名目繁多，有金禅、无为、龙华、悟空、还源、圆顿、弘阳、弥勒、净空、大成、三阳、混源、闻香、罗道等数十种，有的一教数名。它们各不相属，教义颇多歧异，组织、仪轨和活动方式也不尽相同，但或多或少地带有白莲教的印记。
如此一个祸害在，朱由检自然不会允许宗教不接受朝廷的监督。
虽然历史上大部分的起义闹革命，都是民不聊生导致的，朱由检也很同情，那些被欺压的百姓，但是作为皇帝，朱由检可不是自己的国内出现叛乱。
让百姓活下去，靠着对官员的严苛刑罚，等一系列措施，可以办得到。
但是宗教这玩意不好说，毕竟这玩意洗脑的能力实在是太强了。
虽然朱由检并不怕他们搞事，但是朱由检怕叛乱会对会对大明和稳定，造成巨大的影响。