夜晚将近，夕yAn渐渐消失在地平线的一方，深沉的夜晚即将降临在步步走向改变的日本。
近年来，由於西方的工业革命使西方国家的科技是越来越发达，科技发达的国家这时也正把侵略的魔手伸向他国。
这时候的日本虽还未受到列强的侵蚀，但外来的知识和外来的人口正逐渐的移入日本内，他们的进入将为日本带来改革。
西元1865年，被称为明治维新的改革正如火如荼的在全日本展开，日本陷入了两派之间的战争，使日本国内成为了一片火海。
到处都是战争或是暗杀事件，日本已经不再是宁静的国家，也让人民知道新时代即将来临。
攘夷派和德川家的战争一天没有结束，和平的日子就不会出现在日本的街道上。随着战争激烈的展开，人民的生活也越来越没有保障，就算人民因战争流下痛苦的血和泪，战争仍是继续的下去，下去……
也在此同时，一般人所不为知的世界，也正要卷起一GU旋风。
这GU旋风的卷起，是大到足以让世界改变，甚至是国家毁灭的黑暗。
圣杯战争的再度掘起，第二届的圣战也在如此混乱的时局中慢慢展开，并且成为破坏一切的战争。
在距离第一届圣杯战争後，大约过了六十年的时间，在这空白的六十年内，魔术师们是安静的过着自己的生活和等待着圣战的开始。
第一届的圣杯战争，众魔术师都听说了魔术师协会所发出来的消息，也因此他们才会肯耐心的等待圣战的再度展开。
「战争虽胜利了，但胜利者都没有许下任何愿望。」的说法，事实的真相被覆盖，以欺骗世人的方式传下去。
这就是魔术师协会公告给世界各地的魔术师的讯息，虽然魔术师们在看到这份公告时，都有点傻眼，但至少确定的是圣杯的力量确实存在。
他们藉由圣战的结果确信了圣杯的力量，在第一届坐山观斗的众魔术师家族，也在第一届结束之後，开始培养将来能够参加圣杯战争的人材，就为了获得向圣杯许愿的权力。
魔术师们疯狂的教育下一代，不少家族在教育下一代的当家时，都不忘的提醒和洗脑的孩子们，圣杯战争的存在。