北宋朝廷派在歙州的守将，名叫郭师中。因郭师中武艺超强，在东南诸将中，勇不可挡，老虎见了都犯愁，故此有“病关索”之绰号。
病关索郭师中闻听方腊起事，且攻占了清溪、睦州。早已气愤填膺。现在，得知方腊部将鼓噪而来，要攻占歙州，顿时焦躁起来，忙调遣兵力，统兵出城，迎击方腊南军。
方腊军擂鼓前进，郭师中迎面而来。
两军甫经对阵，方腊军中，忽然突出一班披发仗剑的人物，将剑向空一指，随即横剑齐向官军，并力冲入。
因承平已久，官兵本不知战，更提防不住方腊军有妖法，哪个敢去拦阻？霎时间旗乱辙靡，如鸟兽散。郭师中见状，禁遏不住。混乱中，于乱军中驰马冲过来一南将来，大叫一声：“看刀！”咔嚓一下，砍郭师中于马下。可怜有“病关索”之称的郭师中，顷刻间，并一命呜呼了。
南军潮水般冲往歙州。留守歙州官军，见主将阵亡，大惊失色，不战自溃，眼见得歙州被陷。
占领歙州后，吕师囊留兵驻守，遂又率部，挥军东进。吕师囊部，兵锋所向，势不可挡，连克富阳、新城，兵临杭州城下，将至城郭壕边，威逼北宋浙江统治中心杭州。
杭州乃是北宋两浙路的首府，又是造作局所在地，也是朱勔曾经的收刮花石纲指挥中心之一，聚集着大批官吏和富商、地主。
因战略要地，且繁花锦绣，故此，杭州城城郭阔远，人口稠密，北依旱路，南临大江，西面皆湖，守备甚是严谨。
吕师囊部聚集杭州城下，做攻城准备。
为协助吕师囊攻克杭州城，方腊急派皇太子方天定率部驰援，会同吕师囊部，共同围困杭州，伺机攻克。
方天定率两万兵马星夜疾驰，于杭州城下，与会同吕师囊汇合。两人暗自设计，来攻杭州。
杭州知州赵霆，登城西望，遥见寇来如樯，已是惊慌得很。
赵霆正在遥望中，猛然见方腊军阵中，冲出几个长人，约高丈许，首戴神盔，身披氅衣，左手持矛，右手执旗，面目狰狞可怕。那赵霆顿时吓得魂不附体，惊慌错乱。
其实这种长人，统是大木雕成，中作机关，用人按捺，所以两手活动，远望如生。赵霆胆小如鼷，晓得什么真假，当即下城还署。
知州府中，赵霆心神不定，踌躇起来。
踌躇了一阵后，赵霆拿定主意。三十六着，逃为上着。
赵霆竟收拾细软，挈了一妻一妾，趁着城中惊扰的时候，改装出衙，一溜烟地奔出城外，自顾自逃命去了。
杭州置制使陈建，廉访使赵约，见贼军围城，忙趋入州署，想与赵霆会商守御事宜，不意署中已空空洞洞，并无一人。两人见状，急得跌脚；无奈之下，慌忙退出署门。
此刻，方腊匪党已打破城门，一拥入城，攻往知州府。
陈建、赵约刚从知州府署门出来，正迎面碰着鼓噪而来的贼军，逃避不及，双双被缚。
不多时，方腊随后军也进入杭州城中。前军献上陈建、赵约。方腊下令，将陈建、赵钧斩首示众。陈建、赵约遂被斩首，头颅挂于城门之上。
方腊那厮煞是凶狠，既入城中，令党羽遍捕官吏。方腊匪军遂全城搜捕，统共获得若干名，一一绑在州署门前。
方腊高坐堂上，置酒纵饮。
方腊放眼看到绑在州署门前的官吏，遂传令道：“朕饮一盃，你等将所获官吏杀一人，可斩首，可刀剐，务要有趣方好。”
随即，方腊于大堂上纵酒。
方腊每饮一盃，兵士从绑在署门前官吏群中推出一人来，或斩首，或刀剐，变着法儿杀人，最凶的是不令全尸，或()
脔割肢体，或剜取肺肠，或熬煮膏油，或丛镝乱射，备极惨酷。
方腊见状，兴奋异常，高声说道：“就是这般！朕即上位，就是要为民除害，如此这般，方足纾公愤。”
也是朱勔惹了众怒，百姓见状，皆高声叫好，全无怜悯之情。
方腊又下令党徒，四处纵火，满城屠掠，除有姿色的妇女取暴婬乐外，满城军民，多半杀死，直杀了六日方止。
除此之外，方腊还令众匪收刮钱财，以备军资。
吕师囊得知方腊已进入杭州，遂前来觐见方腊。
吕师囊望方腊致礼后，禀道：“吾主在上，臣有所言。”
方腊看了眼吕师襄，说道：“有话就讲！”
吕师囊便奏道：“吾主在上，朱勔作恶，皆是女干臣蔡京使坏；正是那蔡京提携了朱勔，使得朱勔为害俺江南地方。臣闻蔡京祖上坟茔即在杭州，可派人寻找，挖出那厮祖上遗骨，暴于光天化日之下，以泄民愤。”
方腊闻奏，大为赞许，遂派兵士，寻找蔡京祖坟。
方腊党徒，多方打探，寻找到了蔡京祖坟，七手八脚，捣毁了蔡京祖上坟茔，挖出了蔡京祖上遗骨，抛洒于街，算是泄愤。
杭州既破，东南大震，告急警报，有如雪片，飞投京中。
时任宰相乃是刚刚排挤了蔡京的王黼。
此时王黼与童贯串通一气，正准备着按与金人达成的约定，整师北伐，收复云燕十六州呢，故此无暇顾及小寇。
那王黼怕徽宗见责，竟将警奏搁起，并不上奏。因此，江南方腊匪患，深居宫中的徽宗皇帝，并不知情。
时有淮南发运使陈遘，来京办事，见匪情急矣，宰相王黼尚遮掩隐瞒，心中激愤，遂避过王黼，进入宫中，直接奏陈徽宗。至此，徽宗乃始知此番乱事。
徽宗既闻陈遘奏报，大吃一惊，急令童贯为江、淮、荆、浙宣抚使，谭稹为两湖制置使，王禀为统制，分率禁旅，即日南下。
又因陈遘疏中，谓浙兵无用，须调集外旅，速平匪乱。徽宗深以为然，乃复飞饬陕西六路精兵，同时南征。
于是边将辛兴忠、杨惟忠统熙河兵，刘镇统泾原兵，杨可世、赵明统环庆兵，黄迪统鄜延兵，马公直统秦凤兵，冀景统河东兵，六路兵马，共归都统制刘延庆节制。总计内外各军，调赴东南，约得人。
各军陆续南下，免不得费时需日。
至童贯等率兵抵达金陵，已是宣和三年孟春月中。
这时，方腊转陷婺州，又陷衢州。衢州太守彭汝方被执，押至方腊处。不待方腊审问，彭汝方开口便骂，左一个贼，又一个寇，怒骂不休。方腊大怒，令将彭汝方斩首示众。彭如方遂被南军兵士拉出大厅，斩首示众。