董卓按剑叱袁绍曰：“竖子敢然！天下之事，岂不在吾！吾欲为之，谁敢不从！尔谓董卓刀为不利乎！“
袁绍勃然曰：“天下健者，岂惟董公！“引佩刀，双手握刀柄作揖，径自出走。
董卓以新至，见袁绍乃大家子弟，故不敢害。
袁绍悬何进所授的节符于上东门城楼上，逃出洛阳。
八月三十日（公元189年9月27日）（注《资治通鉴》写为九月可能有误），董卓大会百僚，奋首而言曰：“皇帝暗弱，不可以奉宗庙，为天下主。今欲依伊尹、霍光故事，更立陈留王，何如？“
公卿以下皆惶恐，莫敢对。
董卓又高声言道：“昔霍光定策，延年按剑。有敢沮大议，皆以军法从事！“在坐者均震动。
尚书卢植独曰：“昔太甲既立不明，昌邑罪过千余，故有废立之事。今上富于春秋，行无失德，非前事之比也。“
董卓大怒，罢坐，要杀卢植，蔡邕为之求请。
议郎彭伯亦谏董卓曰：“卢尚书海内大儒，人之望也。今先害之，天下震怖。“
董卓乃止，但免去卢植官职。
不久，卢植以年老身体不适为由，请求返回家乡幽州涿郡涿县。
待董卓批准后，卢植便走小路离开洛阳，董卓果然派人追杀而不及。据传，卢植逃走，隐居在幽州上谷郡宁县护乌桓校尉大营附近，不问世事。
护乌桓校尉为并州太原郡人令狐君，名不详。
董卓以废立议示太傅袁隗，袁隗认同。袁绍弃官逃亡，据传去了冀州勃海郡。
九月一日（公元189年9月28日），董卓复会群僚于崇德前殿，以皇帝在丧，无人子之心，威仪不类人君为由，胁迫何太后策废少帝为弘农王，立陈留王协为帝。
尚书丁宫主持废立仪式，太傅袁隗解除少帝刘辩玉玺印绶，双手奉交给陈留王刘协，扶少帝刘辩下殿，然后扶刘协上帝座正式登基。
何太后哽涕，群臣含悲，莫敢言者。
董卓又议：“何太后欺压逼迫永乐宫董太皇太后，至令忧死，乃逆妇姑之礼也。“
于是，迁何太后于永安宫。
赦天下，改元昭宁为永汉。
据传闻，天下各郡县都在杀宦官和其家族为官者。
九月三日（公元189年9月30日），董卓鸩杀何太后，董卓不允许朝廷为何太后举办丧礼，公卿以下不布服，会葬，素衣而已。
只让帝刘协到洛阳城内奉常亭表示哀悼，公卿大臣穿白衣上朝三天。
董卓又发何苗棺，出其尸，支解节断，弃于道边；杀何苗母舞阳君，弃尸于苑枳落中。
诏除公卿以下子弟为郎，以补宦官之职，侍于殿上。
九月十二日（公元189年10月9日），以太尉兼幽州牧刘虞为大司马，封襄贲侯。襄贲县为徐州东海郡的一个县，接壤刘虞的家乡，同郡郯县。
董卓自为太尉，领前将军事，加节传、斧钺、虎贲，更封郿侯。
之前董卓为斄乡侯，属于乡侯，这次封为郿县县侯。
郿县又恰是皇甫嵩重兵驻扎之地，也是皇甫嵩面对联军的前线。
九月十三日（公元189年10月10日），以太中大夫杨彪为司空。洛阳令司马防转任治书御史，都尉诸于继任洛阳令。
免去御史大夫颜敫，任命荆州零陵郡泉陵县人刘优为御史大夫，与副手御史中丞韩馥，主执法和监察，总持朝纲，台阁肃然。
九月二十一日（公元189年10月18日），征召握有兵权的豫州牧关内侯黄琬入朝为司徒。
以河南尹王允为太仆，王允次兄王懋（ào）为侍中。
袁术从虎贲中郎将转任河南尹。汉阳太守金旋入朝为议郎。
樊煜继任汉阳太守，仍在武都郡下辨县临时的汉阳郡府办公务。
董卓率司徒黄琬、司空杨彪诸公卿一同携带斩人的刑具鈇锧到朝堂上书，追理受害的陈蕃、窦武及同人，全部恢复其爵位，遣使吊祠，提拔其子孙为官。
自六月至九月一直阴雨绵绵。
冬，十月三日（公元189年10月29日），葬灵思何太后。董卓趁开启灵帝的陵墓文陵下葬灵思何太后时，使人悉取墓中所藏珍宝。
最初，南单于于扶罗既立，部落人杀其父者遂叛，共立须卜骨都侯为单于。于扶罗上奏朝廷提请诉讼。
恰灵帝崩，天下大乱，朝廷无暇顾及于扶罗的诉讼。
于扶罗军面临断饷断粮的境地。于扶罗于是率数千骑部众与郭太的白波军合兵寇并州太原郡，又攻陷司隶河东郡县，河东郡众多庶民逃往三辅。
董卓遣其将牛辅从陕县过黄河进入河东郡击之，不胜。牛辅退回黄河南岸的陕县董卓军大本营。
时庶民皆聚拢在坞堡等内自保，于扶罗军劫掠得不到任何好处，反而攻坞堡、庄苑时兵卒多有挫伤。
于扶罗又想回归原部落，但原部落人不接受，于扶罗乃屯于河东郡中部的平阳县。
须卜骨都侯为单于上位一年而病死，南匈奴王庭于是空着王位，暂以老王行部落事，也不接纳于扶罗回来继王位。
看完信报，韩遂惊呆了。大将军何进死了！前将军董卓进京把持了朝政！
何进竟然如此呆木，一切都是袁绍一伙人事先设好的局。
只是袁绍看走眼了董卓，认为董卓是亲袁家的将领，竭力引入京师。
袁绍原想用外戚何进家族与宦官火并，再用董卓军灭掉何家，袁家就控制了朝廷。不曾想董卓进京掌权后翻脸不认袁家。
误天下者袁绍矣！
被免去御史大夫职的颜敫，新任御史大夫的刘优、新任洛阳令诸于三人都曾为韩遂在洛阳读太学时的《毛诗》班的同窗，韩遂写信交给探部带给刘优、诸于，希建立联络。
董卓给窦武平反，对在陇西狄道的宝统（窦统）来说定是盼望已久的好消息，可重返洛阳为官。韩遂马上写信通知宝统。
数天后，宝统回信，表示已年过六旬，不看好时局，不愿入朝为官了。但可恢复“窦”姓了，不再称“宝”姓。
此事在凉州望族中引起不小的震动，当年紧锢之祸的逃犯竟然藏在狄道。
听闻宝统就是前雁门太守窦统，窦琼英是大将军窦武之妹，很多望族前来拜访，窦家着实风光起来。
韩遂又给联军各部首领去信：
联军的原目的是铲除遍布朝野的宦官及其族人、同流合污之辈，等朝廷大赦，率凉州子民重归大汉。
天下宦官及家族为官者已诛尽，原目的已达到，天下再无宦官。
故联军新目的更改为等待朝廷大赦，待明君贤臣主持朝政，率凉州子民重归大汉。