满清因为自身人口太少，兵力不足，对投降的实力派军阀都会给予优待，从孔有德等三顺王到吴三桂，再到金声桓、徐勇、李国英等人，基本上都会加官进爵，量才使用，从而笼络了一大批“忠心耿耿”的**部队。
但郑芝龙是个例外。
郑芝龙手下号称二十万大军，跟随他投降的有十一万多人，为满清提供了一支强大的水师，还为清军占领福建立下了大功，却只得了个一等精奇尼哈番的空头官衔，被软禁在燕京多年，最后治罪下狱，被矫诏杀害，在投降满清的军阀中算是混得最惨的一个。
这里面的原因，是博洛等人在捣鬼。
博洛为了骗取战功，谎报军情，把攻占福建的功劳都算在自己头上，虚构了大小 多次战斗，作战的对象当然是郑芝龙，在他给清廷的报告中，郑芝龙拼命抵抗大清王师，被清军打得走投无路才被迫投降，这样的家伙，没杀他就算不错了。
博洛谎报战功并不是个人行为，而是全军上下统一口径，并且得到了朝中豪格一派的默许，所以一定要抹杀郑芝龙的迎降之功，不论郑芝龙如何为清军效命，都注定不会有好下场。
亲身参与这件丑闻的满清贵族太多，郑芝龙到了燕京后守口如瓶，苟且偷生又活了十多年，最后还是被杀人灭口，全族都被斩草除根。对于这件事的真相，顺治成年后并非一无所知，但为了维护朝局稳定，不愿再翻这笔十多年前的烂帐，就把郑芝龙牺牲掉了。
郑芝龙手下号称二十万大军，大部分都出身于海盗，除了中国人之外，还有白人，有黑人，有曰本人，有东南亚人，是一支标准的“八国联军”，除了家属之外，还有很多人是负责海上贸易的船员，不能算真正的军队。
在郑芝龙的二十万大军中，真正能拿得上台面的，是施福等人手下的部队，施福是施琅的族叔，早年是郑芝龙的家将，属于铁杆亲信，他的部队后来跟随李成栋攻入广东，对南明造成了很大的伤害。
郑芝龙要投降满清，遭到了郑成功，郑鸿逵，郑芝豹，郑采以及诸多将领的反对，但他仍然力排众议，完成投降满清的部署，就是因为牢牢掌握着兵权。
这个时候，郑成功在军队里的威望已经很高，郑芝龙也给了他一定的兵权，但由于郑芝龙要投降满清，父子之间的矛盾不断加深，郑芝龙把他的兵权又收了回去。
由于郑芝龙的精锐部队都投降了满清，郑成功刚刚举旗抗清的头两年，手下都是一群乌合之众，几乎打一仗败一仗。
但郑成功在这个时候表现出了他的军事才能，在厦门鼓浪屿专心练兵，用了三年时间练出了一支精锐部队，又通过招降施琅得到了施福手下的一部分精兵，后来终于开创了一番辉煌的事业。
郑成功虽然出身海盗家庭，接受的却是中国传统教育，正儿八经的秀才出身，还差一点当了举人，从郑成功一生的经历来看，他并不是一个枭雄类的人物，对道德的要求近乎苛刻，所以有时候不太灵活，在对待施琅和郑经（他的大儿子）的问题上都有一定的失误。
但是话说来了，如果郑成功是个圆滑的人，就不会坚持抗清，而是跟着郑芝龙投降，去换取荣华富贵了——姓格决定命运，无可非议。
当郑芝龙要投降满清时，郑成功与他决裂是必然的结果，但是为了尽量挽回郑芝龙，郑成功进行了最大的努力，多次苦苦劝谏他的父亲，最后被郑芝龙抓了起来，要不是被郑鸿逵偷偷放走，十有**，会被强行带到燕京。