日军毕竟兵力占优，又被所谓的武士道精神洗脑严重，逐渐在局部战场上积累了一定的兵力优势后，日军还是逐渐扭转了一些局面。战场上，到处可见捉对厮杀的两军士兵，也随处可见已经杀得满身血污却依然还在奋战不休的中日士兵，刀丛枪阵中鲜血喷涌不断，惨叫声吼叫声此起彼伏，杀人者旋即被杀，倒地者还有人拼命抱住了身边的敌人腿脚，为同伴给自己报仇创造机会，光凭刺刀武士刀已经在混战中起不了所有作用，很多的双方士兵都已经用上拳头和石头，乃至牙齿！
以太平军降卒居多的吴军李秀成部自然因此损失严重，然而这些吴军将士却不是白白牺牲，靠着他们争取到的宝贵时间，吴军主力大队已经在大步向着战场冲来，而当吴军主力的前队赶到战场边缘时，还没等数量庞大的掷弹筒炮弹砸到脑袋上，日军上下也没有了继续血战下去的勇气，大呼小叫着只冲向山路，为了更快一步逃命不惜推翻撞翻前方和身边的同伴，之前只是偶尔出现的互相践踏情况开始大规模出现，许多的日军士兵也因此惨死在同伴的草鞋之下。
事还没完，看到援军到来，经验丰富的李秀成并没有急着带着军队撤出战场，选择了带着剩下的兵马裹卷在敌人的密集人群中，和敌人一起乱糟糟的逃进山道，和敌人纠缠着冲向伊敷别院外的日军营地，留守营地的日军上下虽然很快发现了这一危险，却又因为吴军和自家败兵纠缠得太紧的缘故，根本想不出什么办法来阻拦阻止，只能是眼睁睁的看着吴军将士顺着人潮冲进自军营地杀人放火。
日军辛苦修建的营防工事因此彻底宣告报废，先是被自家败兵冲垮正面，又有吴军在内部捣乱，四处纵火烧营，再等吴军主力追杀到营前时，日军也就没有了任何的阻拦办法，被吴军主力一个冲锋就杀进营内，心惊胆裂的日军士兵无法抵抗也不敢抵抗，只能是鬼哭狼嚎着逃出营地，逃进山林旷野去给由日本平民组成的落武者劫杀，或是直接逃向日军指挥部的伊敷别院，妄图躲进有着壕沟院墙保护的寺庙活命。
“八格牙路！这群没用马鹿！”
见此情景，已经先行逃进伊敷别院的岛津久光当然明白伊敷别院已经很难保住，为了活命，岛津久光只能是匆匆带着一些小姓从后门逃出伊敷别院，别院里的守军随之土崩瓦解，越墙出逃者不计其数，然后先是日军败兵蜂拥入城，大肆抢劫后随即弃寺而走，李秀成带着军队紧接着攻入寺中，成功占领伊敷别院，将吴军旗帜插上墙头。
吴军将旗帜插上墙头，不但代表着胜利占领伊敷别院，还成功导致了日军败兵大队的彻底崩溃，看到伊敷别院已经失守，还在营地里与吴军交战的日军更无战心，不管是萨摩藩军还是长州藩军都是争先恐后的撒腿逃命，原本还气势汹汹大喊要一万玉碎的桂小五郎和山县有朋等日军陆军将领也在其中，随着败兵人群狼狈逃向远方，目标是彻底歼灭萨长联军主力的吴军主力果断追击，冲向日军败兵大队。
没有象样的交战，只有残酷的屠杀，追击中，士气高昂的吴军将士个个脚步如飞，在乱成一团的日军败兵中穿插冲刺，肆意砍杀射杀，时而猛扑直冲，直捣敌人大队核心，时而合围包抄，歼灭被围之敌。无数的日军士兵惨死在吴军刀下枪下，更多的日军士兵抛下武器跪地投降，日军彻底土崩瓦解，逃得四面八方都是。
逃亡中，桂小五郎十分聪明的效仿日本古代先贤德川家康，早早就放下了帅旗避免暴露身份，可惜桂小五郎的运气却明显没有老乌龟德川家康那么好，混乱中也不知道是被那一方的一个日军士兵拉住了腿，活生生的拽下了战马，然后等桂小五郎愤怒的用手枪把这个该死的日本士兵打死时，更多的日军败兵却又冲了上来，既抢走了他的战马，又活生生的踩断了他的腿，桂小五郎哭喊求救，可急于逃命的日军士兵却没有一个人搭理他。最后，等吴军追兵冲上前来时，桂小五郎原本还想投降保命，可惜他喊出的日语却没有一个吴军将士能够听懂，一个杀红了眼的吴军士兵还顺手一枪，直接结束了他的性命。
桂小五郎最心爱的武将山县有朋的运气更烂，逃亡中直接被一队吴军将士包围，结果山县有朋倒是很有勇气的举起武士刀和吴军将士拼命，然而他只砍伤了一名吴军将士，马上就被一名吴军什长抬手一枪打中他的面门，死得面目全非。而死得和山县有朋、桂小五郎一样凄惨的日军大小将领，绝不止是十个八个。
数以千计的日军士兵惨遭屠戮，尸骸蜿蜒于大道两旁，铺满田野，填平沟渠，鲜血积洼，染红路旁溪流，各式各样的旗帜散落得到处都是，残缺不全的武器也丢得漫山遍野。这一点固然是在事后让邻近的日本平民百姓发了一笔横财，然而日本明治维新中的另一路主力长州藩却元气大伤，无数即将在明治维新中发挥重要作用的长州藩武士葬身荒野，象无数的萨摩藩维新志士一样，稀里糊涂的惨死在吴军将士的屠刀之下，再也没有办法象历史一样倒幕府，尊天蝗，侵略及祸害无辜的亚洲百姓。
吴军还不止是直接用武力扼杀日本的明治维新，同一时间段的伊敷别院中，李秀成所率领的吴军将士还意外的找到了被岛津久光软禁的萨摩藩傀儡藩主岛津忠义，结果在萨摩藩自有的翻译帮助下，岛津忠义告诉李秀成的第一句话就是，“我投降，我是萨摩藩的藩主，我愿意以藩主的身份，率领萨摩藩的百姓军民服从你们的一切命令，赔偿你们一切应得的损失。”
“你投降可以，但你有家臣大久保利通和西乡隆盛，必须得死！”李秀成很直接的告诉岛津忠义道：“他们是我们镇南王点名要脑袋的人，我们谁也无权饶恕他们。”
“大久保利通已经死了，被你们的快炮打死了。”岛津忠义如实回答，又指了指房门旁的一具尸体，说道：“西乡隆盛就在那里，他是切腹自尽的。”
不肯放心的李秀成用脚翻开西乡隆盛的尸体，看到西乡隆盛至死都没有闭上眼睛，但两只眼睛都是空洞洞的，脸上也没有任何的表情，仿佛死得极其失落，也万分的绝望。李秀成虽身经百战，见过无数的死人尸首，却还是第一次见到如此死不瞑目的人。