在骷髅岛发生此番剧变之前，南极洲灭世三人组所在的科考站，他们的钻探队伍终于在冰层之下找到了沉睡不知道多久的基多拉。
情况如三人组之前推测的那样，近在咫尺的机器轰鸣声丝毫没能惊醒沉睡的基多拉，睡得也是够死的。
三人组看着冰层中体型巨大的基多拉，并未第一时间使用他们口中可以唤醒基多拉的仪器，而是对了对表，欣赏了一番基多拉的身姿后，又返回了地面。
直到数小时后，他们再次兴冲冲的来到冰层底下，并打开了一台能发出低频音波的仪器。
与此同时，墨西哥莫纳岛上的火山口、秘鲁的古老金字塔中、巴西丛林的一处巨大洞窟中，同时发生了剧烈的爆炸。
看来，三人组是真的将他们的计划执行出来了，而且看模样，他们还不只是三人，而是有个庞大的团队，否则无法同时做到这事情。
剧烈的爆炸唤醒了火山中的拉顿、金字塔地下的羽蛇神、巴西丛林中的贝希摩斯，同时，南极冰层中的基多拉也被三人那台仪器发出的低频音波唤醒。
基多拉是一头长着三个巨龙脑袋两条尾巴的巨大怪兽，龙头连接身体的脖子像是巨蛇一样长，而且这家伙生有一对巨大的蝠翼却没有前肢，三个脑袋还能独立思考互相对话。
长长的脖子让这家伙站立时候的身高超过了150米，即便它的脖子相对它的体型又细又长，可依旧算得上是体型最为庞大的怪兽之一了。
而且基多拉并非地球本土的泰坦巨兽，而是不知道多少年前从外太空抵达地球的外来者，它曾经试图一统地球上的所有泰坦巨兽，包括地表和地心的。
当年连哥斯拉都不是它对手，后来在怪兽女皇魔斯拉的帮助下，才联手击败了基多拉，却没能杀死它，让它逃到了南极的冰层之下躲藏了起来。
如今伤势痊愈的基多拉苏醒，只一个伸懒腰的动作就顶破了冰层，当它钻出冰层，准备仰天长啸的时候，南极通往地心世界通道的方向，一头巨兽缓缓走向了基多拉。
来者正是哥斯拉，看起来它是通过地心通道抵达的南极。
两头怪兽多年前就是死敌，如今仇人见面分外眼红，二者朝着对方互相咆哮了一声就撞在了一起，几乎势均力敌。
不过也对，不知道多少年前，基多拉可以稳赢哥斯拉，可现在哥斯拉已经苏醒了几十年了，这些年没少吸收辐射能量，本事见长是自然的事情。
两头巨大怪兽不知道缠斗了多久，看上去依旧是势均力敌，可这只是表象，因为哥斯拉一副如临大敌的模样，基多拉却像是刚睡醒活动了一下筋骨的样子。
基多拉也许是觉得玩的差不多了，三条像蛇一样的脖子缠住了哥斯拉，将其甩了出去，结束了近身肉搏，开始对起波来。
哥斯拉的蓝色的原子吐息vs基多拉金色的反引力射线x3，三个头的优势在这个时候体现的淋漓尽致，哥斯拉在这次对波中彻底败北，不过哥斯拉皮糙肉厚，在反引力射线的轰击下，只受了点皮外伤。